La complejidad de las poblaciones celulares de un organismo crece continuamente con el descubrimiento de biomarcadores y marcadores de linaje. Las disciplinas relacionadas con la inmunología fueron de las primeras en explorar esta complejidad, gracias a la aparición de la citometría de flujo y a las peculiaridades de las células del sistema inmune, fácilmente disgregable en células individuales.

La citometría espectral y la citometría de masas esta contribuyendo a incrementar la complejidad conocida y a la definición de fenotipos de forma cada vez mas detallada. La capacidad de separar estas células vivas mediante técnicas de sorting, o su aislamiento para ensayos NGS.

Además, estas técnicas están permitiendo el análisis con gran nivel de complejidad, dada su elevada capacidad de multiplexado, extendiendo estos estudios a tejidos, cortes histológicos y en general a las situaciones en las que no podemos disponer de células individualizadas.