A complexidade das populações celulares de um organismo cresce continuamente com a descoberta de biomarcadores e marcadores de linhagem. As disciplinas relacionadas com a imunologia foram das primeiras a explorar essa complexidade, graças ao surgimento da citometria de fluxo e às peculiaridades das células do sistema imunitário, facilmente desagregadas em células individuais.

A citometria espetral e a citometria de massas estão a contribuir para aumentar a complexidade conhecida e para a definição de fenótipos de forma cada vez mais detalhada. A capacidade de separar estas células vivas por meio de técnicas de sorting ou isolamento para ensaios NGS.

Além disso, estas técnicas estão permitindo análises com alto nível de complexidade, dada a sua alta capacidade de multiplexação, estendendo esses estudos a tecidos, cortes histológicos e, em geral, a situações em que não podemos ter células individualizadas.