Simplificar para comprender es una estrategia que requiere separar y purificar los diferentes tipos celulares que componen un sistema, o los orgánulos y estructuras subcelulares de las mismas.

Los procedimientos de separación, purificación y fraccionamiento de células y orgánulos, normalmente se realiza en base a procesos físicos, como los diferentes tipos de centrifugación, que aprovechan las diferencias de densidad.

También se pueden realizar mediante procesos mecánicos, que aprovechan diferencias morfológicas o funcionales como la expresión de marcadores, como es el caso de la disección laser, la micromanipulación o la separación por citometría de flujo (sorting)