Genómica


Extracción, purificación, secuenciación y selección de tamaño de ácidos nucleicos, análisis genético con nuevas y exclusivas tecnologías detección y recuento de moléculas tanto de ácidos nucleicos como proteínas mediante el uso de sondas marcadas con un código de barras de colores.

Izasa Scientific le ofrece soluciones integrales en el campo de las Ciencias de la Vida.
Genómica | Izasa Scientific
Nanostring |  Pathways Panel | Izasa Scientific

nCounter PanCancer - Pathways Panel

Panel pre-diseñado que evalúa la expresión de aquellos genes implicados en la formación de procesos oncogénicos.

  • Incluye 606 de los genes más representativos implicados en 13 de las rutas de transducción de señales de procesos oncológicos más relevantes.
  • Notch, Wnt, Hedgehog, TGFB, MAPK, STAT, P13K, RAS, Chromatin Modification, Transcriptional Regulation, DNA Damage Control, Cell Cycle, Apoptosis
  • 124 genes generadores de cáncer
  • 40 genes de referencia
  • También existe la opción de un panel personalizado ¨Panel Plus¨ para incluir 30 genes más a la elección del investigador (nCounter® Panel-Plus & CodeSet-Plus).

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Nanostring_PanCancer-ImmuneProfilingPanel_IzasaScientific

nCounter PanCancer - Immune Profiling Panel

Panel de expresión génica que detecta los perfiles de la respuesta inmune en diferentes tipos de cáncer.

Incluye marcadores para 24 tipos celulares del sistema inmune y poblaciones diferentes, 30 antígenos oncogénicos típicos y genes que representan todas las categorías de la respuesta inmune y los genes inhibidores de sitios ¨checkpoint¨

  • Detecta un total de 109 genes marcadores moleculares de 24 tipos celulares del sistema inmune y poblaciones y 30 genes presentes en los estudios comunes de antígenos de las células T.
  • Más de 500 genes para medir la respuesta inmune.
  • 40 Genes de Referencia (se incluyen 30 controles también presentes en el panel PanCancer Pathways).
  • Al igual que en el caso de los paneles PanCancer Pathway, también existe la opción de un panel personalizado ¨Panel Plus¨ para incluir 30 genes más a la elección del investigador.

APLICACIONES

  • Detección de los tipos celulares infiltrantes.
  • Entender cómo se activan/desactivan las vías de transducción de señales en procesos cancerígenos.
  • Para crear perfiles de respuesta inmune en cualquier tipo de cáncer.

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Nanostring_PanCancerProgressionPanel_IzasaScientific

nCounter PanCancer - Progression Panel

Panel de expresión génica que identifica los genes implicados en la progresión de un tumor.

El panel incluye genes representativos de los cuatro procesos más importantes bien conocidos por contribuir al crecimiento del tumor y su expansión. Entre ellos se incluye la angiogénesis, transición epitelio mesenquimal (EMT), remodelación de la matriz extracelular (ECM) y metástasis.

APLICACIONES

  • Investigación del estadio de la progresión del cáncer.
  • Medición de los efectos del tratamiento en angiogénesis.
  • Estudio de la composición de la matriz extracelular y mecanismos de remodelación.
  • Detección de genes clave que marcan la EMT.
  • Cuantificación de la expresión de genes metastáticos y supresores de tumores.

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Nanostring_Panels_IzasaScientific

nCounter Focus Panels

Paneles de expresión génica especializados.

  • nCounter® Human Immunology v2
  • nCounter® Mouse Immunology kit V1
  • nCounter® Human Inflammation v2
  • nCounter® Mouse Inflammation v2
  • nCounter® Human Kinase V2
  • nCounter® Stem Cell
  • nCounter® Human Breast Cancer ER V1
  • nCounter® Human Reference
  • nCounter® Human Cancer Reference
  • nCounter® Customer Assay Evaluation (CAE)

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Nanostring_Codesets_IzasaScientific

Personalizados: CodeSets

NanoString también ofrece la posibilidad de realizar determinaciones de cualquier gen de interés.

Se denomina CodeSets a la pareja de sondas que hibrida específicamente con un determinado gen de manera directa y que incluye la sonda reporter y la sonda capture. Este tipo de química es la llamada “Química Estándar”.

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 nanostring_tagsets_IzasaScientific

Personalizados: TagSets

NanoString permite realizar determinaciones de cualquier gen de interés mediante otro tipo de química, la “Química Elements”.

Se denomina TagSets a aquellas sondas reporter y capture que hibridarán con un oligo diseñado específicamente para que hibride a su vez con un determinado gen. Esta química usa la misma tecnología de NanoString hasta ahora descrita pero permite al usuario diseñar sus propios targets. Es ideal para realizar proyectos donde se requiere una gran flexibilidad.

  • Se pueden llegar a analizar unos 216 targets personalizados por muestra y por tubo.
  • Cada sonda reporter lleva un barcode que es único para el primer que se vaya a diseñar que detecte un determinado gen.

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VantageTM RNA Panels

Son una colección de paneles de expresión génica que contiene aquellos genes más relevantes en el campo de la investigación oncológica.

Están diseñados para el uso de muestras humanas  e incluyen 192 genes (12 de ellos, housekeeping) con la opción de personalizar hasta 24 más a elección del investigador.

  • nCounter Vantage RNA
  • nCounter Vantage RNA Adaptive Immunity                             
  • nCounter Vantage RNA  Innate Immunity               
  • nCounter Vantage RNA Cellular Profiling
  • nCounter Vantage RNA Cancer Metabolism
  • nCounter Vantage RNA-DNA Damage and Repair
  • nCounter Vantage RNA Wnt Pathways
  • nCounter Vantage RNA Cellular Signalling

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La tecnología Nanostring | Izasa Scientific

La tecnología Nanostring

La tecnología exclusiva Nanostring permite cuantifi car digitalmente moléculas de RNA, DNA y proteínas directamente gracias a un sistema de identificación mediante un código de colores asociado a cada molécula.

Este sistema de análisis digital utiliza dos pares de sondas específicas que se hibridan directamente con la muestra del ácido nucleico, eliminando reacciones enzimáticas que podrían introducir sesgos en los resultados. Una es la llamada sonda reportera, que está marcada con seis fluorocromos de cuatro colores diferentes, y cuya combinación dispuesta en serie de éstos da lugar a un “código de color” único para cada diana. La sonda de captura está conjugada con biotina, y se usa para la inmovilización del complejo sonda/diana en el cartucho recubierto con estreptavidina.


Entre sus muchas aplicaciones, destaca el análisis cuantitativo de la expresión génica, por no necesitar retrotranscripción ni amplifi cación posterior. Esto hace que esta tecnología sea ideal para estudios en donde el ácido nucleico es aislado de muestras con componentes que favorecen su degradación, como por ejemplo, los bloques de biopsia FFPE, puesto que la detección es directa y sólo precisa de 100 nt continuos. Además, es capaz de multiplexar hasta 800 marcadores en una sola muestra, permitiendo obtener una gran cantidad de información de forma coherente y reproducible a partir de bajas cantidades de RNA.

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